MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002944	CAC	2	6	105162	105167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406196
2502	NC_002944	CGA	2	6	105275	105280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406196
2503	NC_002944	GCC	2	6	105356	105361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406196
2504	NC_002944	CCG	2	6	105419	105424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406196
2505	NC_002944	GTT	2	6	105459	105464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406196
2506	NC_002944	CTG	2	6	105494	105499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406196
2507	NC_002944	GCC	2	6	106077	106082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406197
2508	NC_002944	GAA	2	6	106094	106099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406197
2509	NC_002944	GCAG	2	8	106175	106182	25 %	0 %	50 %	25 %	41406197
2510	NC_002944	CAC	2	6	107069	107074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406198
2511	NC_002944	CGG	2	6	107076	107081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406198
2512	NC_002944	GCT	2	6	107102	107107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406198
2513	NC_002944	CTG	2	6	107112	107117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406198
2514	NC_002944	CTGA	2	8	107205	107212	25 %	25 %	25 %	25 %	41406198
2515	NC_002944	GCG	2	6	107213	107218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406198
2516	NC_002944	TCG	2	6	107227	107232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406198
2517	NC_002944	CCG	2	6	107236	107241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406198
2518	NC_002944	CAG	2	6	107328	107333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406198
2519	NC_002944	AAC	2	6	107365	107370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406198
2520	NC_002944	CGA	2	6	107402	107407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406198
2521	NC_002944	TGA	2	6	107411	107416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406198
2522	NC_002944	TGG	2	6	107423	107428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406198
2523	NC_002944	GCC	2	6	107440	107445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406198
2524	NC_002944	ACC	2	6	107551	107556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406199
2525	NC_002944	CGCCC	2	10	107662	107671	0 %	0 %	20 %	80 %	41406199
2526	NC_002944	TCA	2	6	107735	107740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406199
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2529	NC_002944	TGCC	2	8	107795	107802	0 %	25 %	25 %	50 %	41406199
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2534	NC_002944	GC	3	6	107989	107994	0 %	0 %	50 %	50 %	41406199
2535	NC_002944	CGT	2	6	108066	108071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406199
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2537	NC_002944	CGT	2	6	108133	108138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406199
2538	NC_002944	GC	3	6	108382	108387	0 %	0 %	50 %	50 %	41406200
2539	NC_002944	CGC	2	6	108389	108394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406200
2540	NC_002944	TGG	2	6	108445	108450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406200
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2547	NC_002944	CGGC	2	8	108856	108863	0 %	0 %	50 %	50 %	41406200
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2549	NC_002944	GCT	2	6	109245	109250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406201
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2551	NC_002944	AC	3	6	109313	109318	50 %	0 %	0 %	50 %	41406201
2552	NC_002944	TCG	2	6	109322	109327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406201
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2554	NC_002944	TCG	2	6	109350	109355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406201
2555	NC_002944	CA	3	6	109379	109384	50 %	0 %	0 %	50 %	41406201
2556	NC_002944	CAG	2	6	109393	109398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406201
2557	NC_002944	ATCC	2	8	109458	109465	25 %	25 %	0 %	50 %	41406201
2558	NC_002944	GACCG	2	10	109471	109480	20 %	0 %	40 %	40 %	41406201
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2561	NC_002944	ATGCCG	2	12	110925	110936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41406202
2562	NC_002944	GCC	2	6	110954	110959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406202
2563	NC_002944	CGG	2	6	110997	111002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406202
2564	NC_002944	AACC	2	8	111040	111047	50 %	0 %	0 %	50 %	41406202
2565	NC_002944	CGA	2	6	111078	111083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406202
2566	NC_002944	TCGG	2	8	111118	111125	0 %	25 %	50 %	25 %	41406202
2567	NC_002944	TTC	2	6	111131	111136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406202
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2570	NC_002944	CCG	2	6	111157	111162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406202
2571	NC_002944	GGT	2	6	111184	111189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406202
2572	NC_002944	CGA	2	6	111229	111234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406202
2573	NC_002944	GGT	2	6	111406	111411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406202
2574	NC_002944	GTC	2	6	111422	111427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406202
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2580	NC_002944	GAC	2	6	111821	111826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406202
2581	NC_002944	CAA	2	6	111898	111903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406202
2582	NC_002944	CGC	2	6	111914	111919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406202
2583	NC_002944	CGT	2	6	111925	111930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406202
2584	NC_002944	CGC	2	6	111949	111954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406202
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2586	NC_002944	TCG	2	6	111981	111986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406202
2587	NC_002944	ACG	2	6	111993	111998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406202
2588	NC_002944	TC	3	6	112024	112029	0 %	50 %	0 %	50 %	41406202
2589	NC_002944	ACC	2	6	112034	112039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406202
2590	NC_002944	CGC	2	6	112093	112098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406202
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2592	NC_002944	GCG	2	6	113194	113199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
2593	NC_002944	CGG	2	6	113208	113213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
2594	NC_002944	CTT	2	6	113238	113243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406203
2595	NC_002944	GAG	2	6	113278	113283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406203
2596	NC_002944	G	6	6	113349	113354	0 %	0 %	100 %	0 %	41406203
2597	NC_002944	TTGG	2	8	113386	113393	0 %	50 %	50 %	0 %	41406203
2598	NC_002944	TCC	2	6	113416	113421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406203
2599	NC_002944	GCT	2	6	113472	113477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406203
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2601	NC_002944	GGCG	2	8	113595	113602	0 %	0 %	75 %	25 %	41406203
2602	NC_002944	AGC	2	6	113618	113623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406203
2603	NC_002944	AGC	2	6	113627	113632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406203
2604	NC_002944	CG	3	6	113646	113651	0 %	0 %	50 %	50 %	41406203
2605	NC_002944	TCGT	2	8	113695	113702	0 %	50 %	25 %	25 %	41406203
2606	NC_002944	GCG	2	6	113728	113733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
2607	NC_002944	CGT	2	6	113757	113762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406203
2608	NC_002944	TGG	2	6	113798	113803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406203
2609	NC_002944	GGC	2	6	113808	113813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
2610	NC_002944	ACCA	2	8	113828	113835	50 %	0 %	0 %	50 %	41406203
2611	NC_002944	GTC	2	6	113836	113841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406203
2612	NC_002944	CTG	2	6	113851	113856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406203
2613	NC_002944	AGGCCA	2	12	113862	113873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406203
2614	NC_002944	GGC	3	9	113911	113919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
2615	NC_002944	GCG	2	6	113930	113935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
2616	NC_002944	CG	3	6	114022	114027	0 %	0 %	50 %	50 %	41406203
2617	NC_002944	TCG	2	6	114029	114034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406203
2618	NC_002944	TGG	2	6	114045	114050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406203
2619	NC_002944	GCG	2	6	114059	114064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
2620	NC_002944	CGGTG	2	10	114075	114084	0 %	20 %	60 %	20 %	41406203
2621	NC_002944	CGG	2	6	114114	114119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406203
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2623	NC_002944	GCA	2	6	114255	114260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406203
2624	NC_002944	GCA	2	6	114279	114284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406203
2625	NC_002944	CGA	2	6	114291	114296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406203
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2629	NC_002944	CA	3	6	114415	114420	50 %	0 %	0 %	50 %	41406203
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2632	NC_002944	AC	3	6	114550	114555	50 %	0 %	0 %	50 %	41406203
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2739	NC_002944	GCG	2	6	119369	119374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406207
2740	NC_002944	GGCC	2	8	119381	119388	0 %	0 %	50 %	50 %	41406207
2741	NC_002944	CGA	2	6	119441	119446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406207
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2743	NC_002944	CAT	2	6	119582	119587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406207
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2745	NC_002944	GCA	2	6	119666	119671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406207
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2870	NC_002944	CGA	2	6	124551	124556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406211
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2989	NC_002944	ACC	2	6	128956	128961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406217
2990	NC_002944	GC	3	6	128962	128967	0 %	0 %	50 %	50 %	41406217
2991	NC_002944	GCC	2	6	128988	128993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
2992	NC_002944	GTT	2	6	128994	128999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406217
2993	NC_002944	GCG	2	6	129008	129013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406217
2994	NC_002944	GAG	2	6	129018	129023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406217
2995	NC_002944	TGA	2	6	129194	129199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406217
2996	NC_002944	CGT	2	6	129206	129211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406217
2997	NC_002944	CCG	2	6	129233	129238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
2998	NC_002944	GC	3	6	129242	129247	0 %	0 %	50 %	50 %	41406217
2999	NC_002944	CACC	2	8	129290	129297	25 %	0 %	0 %	75 %	41406217
3000	NC_002944	GCG	2	6	129348	129353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406217

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